Here is a checklist for the share folder results.
${BASEDIR}/data/share
├── amico
│ ├── noddi_roi
│ └── a figure and html file for each scan
├── ciftify
│ └── qc_recon_all
├── enigmaDTI
│ ├── ADskel_qc_index.html
│ ├── FAskel_qc_index.html
│ ├── group_engimaDTI_nvoxels.csv
│ ├── group_enigmaDTI_AD.csv
│ ├── group_enigmaDTI_FA.csv
│ ├── group_enigmaDTI_MD.csv
│ ├── group_enigmaDTI_RD.csv
│ ├── MDskel_qc_index.html
│ ├── RDskel_qc_index.html
│ └── each subject files
├── ENIGMA_extract
│ ├── CorticalMeasuresENIGMA_SurfAvg.csv
│ ├── CorticalMeasuresENIGMA_ThickAvg.csv
│ └── LandRvolumes.csv
├── fmriprep/23.2.3
│ └── qc images and meta data for each scan
├── smriprep/23.2.3
│ └── qc images and meta data for each scan
├── freesurfer_group
│ └── freesurfer group analysis tsv files, including thickness, euler and aseg
├── mriqc/24.0.0
│ ├── dataset_description.json
│ ├── group_bold.tsv
│ ├── group_T1w.tsv
│ └── group_T2w.tsv
├── qsiprep/0.22.0
│ ├── qsiprep_metrics.csv
│ └── qc images and meta data for each scan
├── tractify
│ └── connectivity.mat file
├── xcp-d/0.7.3
│ └── qc images and meta data for each scan
└── xcp-noGSR/0.7.3
└── qc images and meta data for each scan