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Solstice.Skyfall.100.vcf
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##fileformat=VCFv4.0
##reference=hopefullyIWGCCRefseq1.1
##source: extract_SNPs.pl -s Solstice.Skyfall.list -v data/FINAL_35K_all_varieties_for_Guy.vcf -p 1 -m 0
#CHROM POS ID REF ALT QUAL FILTER INFO K20_Solstice A02_Skyfall
chr7B 708482422 BA00000966;AX-94381419 A G . . . 0/1 1/1
chr2A 72747242 BA00001124;AX-94381449 G A . . . 0/0 1/1
chr2D 575180478 BA00002167;AX-94381628 C T . . . 1/1 0/0
chr1D 447222426 BA00002234;AX-94381637 C T . . . 0/0 1/1
chr3D 7230435 BA00002791;AX-94381736 T A . . . 1/1 0/0
chr1B 14510697 BA00004081;AX-94381968 C T . . . 0/0 0/1
chr2B 775165476 BA00004092;AX-94381971 G C . . . 0/1 0/0
chr5A 28103951 BA00004355;AX-94382012 T C . . . 0/0 1/1
chr3B 13756236 BA00004648;AX-94382065 C T . . . 0/1 0/0
chr2A 733530836 BA00005105;AX-94382147 T C . . . 0/0 0/1
chr2B 727219779 BA00006657;AX-94382426 T G . . . 0/0 0/1
chr3D 392956626 BA00007575;AX-94382595 G A . . . 0/1 0/0
chr6B 408654086 BA00008180;AX-94382687 C T . . . 1/1 0/1
chr5A 571428171 BA00008202;AX-94382691 A G . . . 0/0 1/1
chr1A 309401536 BA00009038;AX-94382831 G A . . . 1/1 0/0
chr2A 81007773 BA00009255;AX-94382888 T G . . . 1/1 0/0
chr5B 15553300 BA00009348;AX-94382905 T C . . . 0/0 1/1
chr7A 668252588 BA00009586;AX-94382946 G C . . . 0/0 1/1
chr4D 446429873 BA00009796;AX-94382988 G T . . . 0/0 1/1
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chr3B 485689855 BA00010446;AX-94383106 A C . . . 1/1 0/0
chr4B 579391929 BA00010883;AX-94383186 C G . . . 0/0 1/1
chr1D 387425630 BA00011849;AX-94383370 T G . . . 0/1 0/0
chr7B 37854718 BA00012666;AX-94383522 G A . . . 0/0 1/1
chr7D 13601754 BA00013285;AX-94383624 G A . . . 0/1 0/0
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chr7A 644621379 BA00016634;AX-94384239 A G . . . 0/0 1/1
chr7D 629382224 BA00017569;AX-94384437 T C . . . 0/0 1/1
chr7A 592907405 BA00019221;AX-94384726 T C . . . 0/0 1/1
chr1B 361367700 BA00020880;AX-94385019 G T . . . 0/0 0/1
chr6D 89733814 BA00021624;AX-94385138 G A . . . 0/0 1/1
chr3D 17521894 BA00022157;AX-94385234 G A . . . 0/1 0/0
chr1B 596494020 BA00022506;AX-94385310 G T . . . 1/1 0/1
chr7D 541241558 BA00022602;AX-94385333 C A . . . 1/1 0/1
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chr5B 656727661 BA00024907;AX-94385728 T C . . . 1/1 0/0
chr1B 660529572 BA00025913;AX-94385888 G A . . . 1/1 0/1
chr1B 606635483 BA00025980;AX-94385896 T C . . . 1/1 0/0
chr1D 305587536 BA00026402;AX-94385971 A G . . . 0/0 1/1
chr5D 562340881 BA00026692;AX-94386025 T C . . . 0/0 0/1
chr7B 676412202 BA00026724;AX-94386031 A G . . . 0/1 1/1
chr2B 654485976 BA00027337;AX-94386142 G A . . . 0/1 1/1
chr7A 667214428 BA00027968;AX-94386267 G A . . . 0/0 1/1
chr2B 724747722 BA00028008;AX-94386275 G A . . . 1/1 0/1
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chr3D 601499583 BA00031337;AX-94386848 A G . . . 1/1 0/1
chr4B 553258318 BA00031374;AX-94386855 G A . . . 0/0 1/1
chr3B 24940309 BA00032645;AX-94387053 T C . . . 0/0 0/1
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chr7B 611458865 BA00033920;AX-94387271 G A . . . 0/0 0/1
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chr4A 674756280 BA00050657;AX-94390315 A T . . . 0/0 0/1
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chr2D 625149809 BA00054156;AX-94390939 C T . . . 1/1 0/0
chr2D 554545520 BA00054506;AX-94390988 C T . . . 0/1 1/1
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chr6D 384294397 BA00065897;AX-94393025 G A . . . 1/1 0/1
chr2B 19070562 BA00065898;AX-94393026 C T . . . 0/0 0/1
chr2D 80820393 BA00067979;AX-94393403 A G . . . 0/0 1/1
chr7B 741572238 BA00068203;AX-94393446 T A . . . 0/0 1/1
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