old_mkdocs.yml

site_name: Informatique
repo_url: https://github.com/gdemare/informatique/
repo_name: gdemare/informatique
edit_uri: edit/main/docs/

# mkdocs.yml
theme:
  language: fr
  name: "material"
  features:
    - content.action.edit # bouton edit
    - content.action.view # bouton voir
    - content.tabs.link
    - content.code.copy
     - toc.integrate # réuni le plan et le sommaire
    #- header.autohide
    - navigation.tabs #onglet
    - navigation.tabs.sticky #menu avec les onglets tout le temps visible
    - navigation.sections # section dans le menu a gauche
    # - navigation.expand # menu a gauche déroulant ouvert apr défaut
    - navigation.path # affiche le chemin au début de la page.
    - navigation.top # bouton pour remonter en haut
    # - navigation.indexes # pour avoir une page d'index dans chaque partie
    - content.code.copy # pour copier le code
  palette:
      scheme: slate
      primary: blue grey
      accent: indigo
  font:
    text: Roboto
    code: Roboto Mono
    
  theme:
    icon:
      edit: material/pencil

plugins:
  - search
  - mkdocstrings
  - glightbox #pour les images
  - git-revision-date-localized: #pour avoir la date de maj 
      type: date

markdown_extensions:
  - pymdownx.tabbed:
      alternate_style: true
  - admonition
  - pymdownx.details
  - pymdownx.superfences # les blocs note, warning,...
  - pymdownx.arithmatex: # les formules mathématiques
      generic: true
  - tables # les tableaux
  
extra_javascript:
  - javascripts/mathjax.js
  - https://polyfill.io/v3/polyfill.min.js?features=es6
  - https://cdn.jsdelivr.net/npm/mathjax@3/es5/tex-mml-chtml.js

nav:
  - "Base de données" :
    - "Fichier" :
      - "JSON" : database/json.md
    - "Langage" :
      - "SQL" : database/sql.md
    - "Logiciels" :
      - "Business Object" : database/business-object.md
      - "Talend" : database/talend.md
  - Programmation :
    - "Bonnes pratiques" :   
      - "Bonnes pratiques" : programming/bonnes-pratiques.md
      - "Github" : sofwares-os-unix/software/github.md
      - "Git" : programming/git.md
      - "Visual Studio Code" : sofwares-os-unix/software/visual-code-studio.md
    - "Java" : programming/java.md
    - "Web" : 
      - "CSS" : programming/web/css.md
      - "HTML" : programming/web/html.md
      - "Java Script" : programming/web/java-script.md
      - "PHP" : programming/web/php.md
    - Unix :
      - "Bash" : sofwares-os-unix/unix/bash.md
      - "Batch" : sofwares-os-unix/unix/batch.md
      - "Folders in Linux" : sofwares-os-unix/unix/folders-linux.md
      - "PowerShell" : sofwares-os-unix/unix/powershell.md
      - "Shell" : sofwares-os-unix/unix/shell.md
      - "Vim" : sofwares-os-unix/unix/vim.md
  - Python :
    - "Bases" : 
      - "Python" : python/python_py.md
      - "Formats" : python/formater-données_py.md
      - "Dataframe" : python/manipuler-donnees_py.md
      - "Tenseur" : python/tenseur_py.md
      - Divers :
        - "Carthographie" : python/carte_py.md
        - "Tableau de bord" : python/tableau-de-bord_py.md
        - "Traitement du signal" : python/traitement-signal_py.md
        - "Traitement des images" : python/traitement-image_py.md
        - "Web scraping" : python/web-scraping_py.md
        - "Autres modules" : python/modules-supplementaires_py.md
      - "Ressources" : python/ressources_py.md
      - "Bioinformatique" :
        - "Séquence" : python/sequence_py.md
        - "Spectrométrie de masse" : python/spectrometrie_py.md
    - "Mathématique" :
      - "Base" : "python/math/math_py.md"
      - "Statistique" :
        - "Lois" : python/math/lois-statistiques_py.md
        - "Tests" : python/math/tests_py.md
    - "Description" :
      - "Graphiques" : python/math/graphiques_py.md
      - "Clustering" : 
        - "CAH" : python/clustering/CAH_py.md
      - "Réduction de dimensions" :
        - "ACP" : python/reduction-dimensions/ACP_py.md
    - "Modèles" :
      - "Modèles" : python/models/models_py.md
      - "Arbre de décision" : python/models/arbre-decision_py.md
      - "Régression" : python/models/regression_py.md
      - "Réseaux de neurones" :
        - "Couche convulsive" : python/models/neural-network/couche-convulsive_py.md
        - "Pytorch" : python/models/neural-network/RN-pytorch_py.md
        - "Tensorflow" : python/models/neural-network/RN-tensor-flow_py.md
  - R :
    - "Bases" :
      - "R" : r/r_r.md
      - "Formats" : r/formater-donnees_r.md
      - "Dataframe" : r/manipuler-donnees_r.md
      - "PKNCA & units" : r/PKNCA-units_r.md
      - "Divers" :
        - "BLAST" : r/bioinformatique/blast_r.md
        - "Carthographie" : r/carte_r.md
        - "Cinétique" : r/cinetique_r.md
        - "Développer en R" : r/developper_r.md
        - "Programme indépendant" : r/programme-independant_r.md
        - "Rapport" : r/rapport_r.md
        - "Tableau de bord" : r/tableau-de-bord_r.md
      - "Ressources" : r/ressources_r.md
    - "Mathématique" :
      - "Probabilité et statistique" : r/probabilite-statistique_r.md
    - "Descriptions" :
      - "Graphiques" : r/graphiques_r.md
      - "Clustering" :
        - "Clustering" : r/clustering/clustering_r.md
        - "CAH" : r/clustering/CAH_r.md
        - "Centres mobiles" : r/clustering/centres-mobiles_r.md
      - "Réduction de dimensions" :
        - "ACM" : r/reduction-dimensions/ACM_r.md
        - "ACP" : r/reduction-dimensions/ACP_r.md
        - "AFC" : r/reduction-dimensions/AFC_r.md
        - "Positionnement multidimensionnel" : r/reduction-dimensions/positionnement-multidimensionnel_r.md
    - "Modèles" :
      - "Préparation des données" : r/models/preparer-donnees_r.md
      - "Prédire et évaluer un modèle" : r/models/prediction_r.md
      - "Type classification" : r/models/classification_r.md
      - "Type régression" : r/models/regression_r.md
      - "Classification" :
        - "ANOVA" : r/models/classification/ANOVA_r.md
        - "Analyse discriminante" : r/models/classification/analyse-discriminante_r.md
        - "Arbre de décision" : r/models/classification/arbre-decision_r.md
        - "Classificateur baysien" : r/models/classification/classificateur-baysien_r.md
        - "Forêt aléatoire" : r/models/classification/foret-aleatoire_r.md
        - "Régression logistique" : r/models/classification/regression-logistique_r.md
        - "SVM" : r/models/classification/SVM_r.md
      - "Régression" :
        - "Régression linéaire" : r/models/regression/regression-lineaire_r.md
        - "Step" : r/models/regression/step.md
      - "Réseau de neurones" : r/models/reseau-neurones_r.md
      - "Série temporelle" :
        - "Série temporelle simple" : r/models/time-series/serie-temporelle-simple_r.md
  - SAS :
    - "Manipuler les données" : SAS/manipuler-donnees_sas.md
    - "Formater les données" : SAS/formater-donnees_sas.md
    - "Automatiser SAS" : SAS/automatiser_sas.md
    - "Centroides" : SAS/centroide_sas.md
    - Statistique :
      - "ANOVA" : SAS/statistique/ANOVA_sas.md
      - "Probabilité statistique" : SAS/statistique/probabilite-statistique_sas.md
      - "Tests" : SAS/statistique/tests_sas.md
      - "Modèles" :
        - "Analyse discriminante" : SAS/models/analyse-discriminante_sas.md
        - "Arbre de décision" : SAS/models/arbre-de-decision_sas.md
        - "Espérance maximisation" : SAS/models/esperance-maximisation_sas.md
        - "Régression logistique" : SAS/models/regression-logistique_sas.md
        - "Régression linéaire" : SAS/models/regression-lineaire_sas.md
    - "Description" :
      - "Graphiques" : SAS/statistique/graphiques_sas.md
      - "Clustering" :
        - "CAH" : SAS/clustering/CAH_sas.md
        - "Centres mobiles" : SAS/clustering/centres-mobiles_sas.md
        - "Cluestering des variables" : SAS/clustering/clustering-variables_sas.md
      - "Réduction de dimensions" :
        - "ACM" : SAS/reduction-dimensions/ACM_sas.md
        - "ACP" : SAS/reduction-dimensions/ACP_sas.md
        - "AFC" : SAS/reduction-dimensions/AFC_sas.md
  - "Softwares OS et Unix" :
    - Bioinformatique :
      - "Séquences" : bioinformatique/sequences.md
    - OS :
      - "Android" : sofwares-os-unix/os/android.md
      - "Ubuntu" : sofwares-os-unix/os/ubuntu.md
    - "Windows" :
      - "Windows" : sofwares-os-unix/os/windows.md
      - "Excel" : sofwares-os-unix/software/excel.md
      - "Microsoft Office" : sofwares-os-unix/software/microsoft-office.md
    - Softwares :
      - "Cross plateform" : sofwares-os-unix/software/cross-plateforme.md
      - "Fidji" : sofwares-os-unix/software/fidji.md
      - "Premier Pro" : sofwares-os-unix/software/premiere-pro.md
      - "Web apps" : sofwares-os-unix/software/webapp.md
    - "Listes" : 
      - "Bio informatique" : sofwares-os-unix/bioinformatique.md
      - "Statistiques" : sofwares-os-unix/software/logiciels-statistiques.md