From fba265458f7e811e154724e60e553d66fc8df38a Mon Sep 17 00:00:00 2001 From: gdemare <44768462+gdemare@users.noreply.github.com> Date: Fri, 13 Dec 2024 15:03:19 +0100 Subject: [PATCH] a --- docs/.obsidian/workspace.json | 21 +++--------------- .../projet_transcriptomique.md" | 22 ------------------- 2 files changed, 3 insertions(+), 40 deletions(-) delete mode 100644 "docs/biologie/biochimie/prot\303\251ines/projet_transcriptomique.md" diff --git a/docs/.obsidian/workspace.json b/docs/.obsidian/workspace.json index 28dd7dfb8..8245dab0a 100644 --- a/docs/.obsidian/workspace.json +++ b/docs/.obsidian/workspace.json @@ -20,23 +20,8 @@ "icon": "lucide-file", "title": "traduction" } - }, - { - "id": "d52d7a7f727a90ec", - "type": "leaf", - "state": { - "type": "markdown", - "state": { - "file": "biologie/biochimie/protéines/etude des protéines.md", - "mode": "source", - "source": false - }, - "icon": "lucide-file", - "title": "etude des protéines" - } } - ], - "currentTab": 1 + ] } ], "direction": "vertical" @@ -177,10 +162,10 @@ "command-palette:Ouvrir la palette de commandes": false } }, - "active": "d52d7a7f727a90ec", + "active": "87dc442f218cc64f", "lastOpenFiles": [ - "biologie/biochimie/protéines/étude des protéines.md", "biologie/biochimie/protéines/etude des protéines.md", + "biologie/biochimie/protéines/étude des protéines.md", "biologie/méthodes/chromatographie.md", "biologie/biochimie/protéines/modification post traductionelle.md", "biologie/biochimie/protéines/adressage des proteines.md", diff --git "a/docs/biologie/biochimie/prot\303\251ines/projet_transcriptomique.md" "b/docs/biologie/biochimie/prot\303\251ines/projet_transcriptomique.md" deleted file mode 100644 index 0e1d75744..000000000 --- "a/docs/biologie/biochimie/prot\303\251ines/projet_transcriptomique.md" +++ /dev/null @@ -1,22 +0,0 @@ - -Transcriptomique étude de l'ensemble des ARNm. -+ -Spatiale est d'obtenir l'information sur la localisation tissulaire. - -Plusieurs possibilités : - -- le type cellulaire (par exemple, en triant préalablement les cellules). -- portion de surface tissulaire (plusieurs niveaux de granularité possible) -> nous on se concentre sur les méthodes qui permet une résolution spatiale au maximum à quelques cellules - -- 10x Genomics Visium : Capture ARN avec des lames contenant des oligonucléotides spatialement codés. Séquençage NGS pour reconstruction spatiale. -- NanoString GeoMx DSP : tissu sur lame. hybridation une sonde avec un barre code 10micron. Tissu FFPE (fixé au chloroforme) ou gelé. -- MERFISH -- SeqFISH+ -- ST - -Source - -* [Transcriptomique spatiale](https://www.france-genomique.org/expertises-technologiques/transcriptomique-spatiale/) - - I) approches ciblées ou multiplexées à base de sondes ou d’anticorps - II) approches à l’échelle du transcriptome ou basées sur le séquençage de nouvelle génération (NGS). La plupart des technologies d’omique spatiale avec une résolution au niveau subcellulaire sont effectuées sur lame (in situ) en utilisant soit la microscopie soit du séquençage haut débit [2]. \ No newline at end of file