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species list

Marta Bleda edited this page Mar 3, 2015 · 2 revisions
species Name Scientific name Assembly
hsapiens human Homo sapiens GRCh37.p13
mmusculus mouse Mus musculus GRCm38.p2)
rnorvegicus rat Rattus norvegicus Rnor_5.0)
ptroglodytes chimp Pan troglodytes CHIMP2.1.4)
ggorilla gorilla Gorilla gorilla gorGor3.1)
pabelii orangutan Pongo abelii PPYG2)
mmulatta macaque Macaca mulatta MMUL 1.0)
sscrofa pig Sus scrofa Sscrofa10.2)
cfamiliaris dog Canis familiaris CanFam 3.1)
ecaballus horse Equus caballus Equ Cab 2)
ocuniculus rabbit Oryctolagus cuniculus OryCun2.0)
ggallus chicken Gallus gallus Galgal4)
btaurus cow Bos taurus UMD3.1)
fcatus cat Felis catus Felis_catus_6.2)
drerio zebrafish Danio rerio Zv9)
cintestinalis Ciona intestinalis KH)
dmelanogaster fruitfly Drosophila melanogaster BDGP 5)
dsimulans Drosophila simulans dsim_caf1)
dyakuba Drosophila yakuba dyak_caf1)
agambiae mosquito Anopheles gambiae AgamP4)
celegans worm Caenorhabditis elegans WS235)
scerevisiae yeast Saccharomyces cerevisiae R64-1-1)
spombe Schizosaccharomyces pombe ASM294v2)
afumigatus Aspergillus fumigatus TIGR)
aniger Aspergillus niger DSM)
anidulans Aspergillus nidulans ASM1142v1)
aoryzae Aspergillus oryzae NITE)
pfalciparum malaria parasite Plasmodium falciparum 3D7)
lmajor Plasmodium falciparum ASM276v1)
athaliana Arabidopsis thaliana TAIR10)
alyrata Arabidopsis lyrata v.1.0)
bdistachyon Brachypodium distachyon v1.0)
osativa Oryza sativa Indica ASM465v1)
gmax Glycine max V1.0)
vvinifera Vitis vinifera IGGP_12x)
zmays Zea mays AGPv3)