-
Notifications
You must be signed in to change notification settings - Fork 1
/
Copy path11_PointPatterns.qmd
1017 lines (761 loc) · 34 KB
/
11_PointPatterns.qmd
1
2
3
4
5
6
7
8
9
10
11
12
13
14
15
16
17
18
19
20
21
22
23
24
25
26
27
28
29
30
31
32
33
34
35
36
37
38
39
40
41
42
43
44
45
46
47
48
49
50
51
52
53
54
55
56
57
58
59
60
61
62
63
64
65
66
67
68
69
70
71
72
73
74
75
76
77
78
79
80
81
82
83
84
85
86
87
88
89
90
91
92
93
94
95
96
97
98
99
100
101
102
103
104
105
106
107
108
109
110
111
112
113
114
115
116
117
118
119
120
121
122
123
124
125
126
127
128
129
130
131
132
133
134
135
136
137
138
139
140
141
142
143
144
145
146
147
148
149
150
151
152
153
154
155
156
157
158
159
160
161
162
163
164
165
166
167
168
169
170
171
172
173
174
175
176
177
178
179
180
181
182
183
184
185
186
187
188
189
190
191
192
193
194
195
196
197
198
199
200
201
202
203
204
205
206
207
208
209
210
211
212
213
214
215
216
217
218
219
220
221
222
223
224
225
226
227
228
229
230
231
232
233
234
235
236
237
238
239
240
241
242
243
244
245
246
247
248
249
250
251
252
253
254
255
256
257
258
259
260
261
262
263
264
265
266
267
268
269
270
271
272
273
274
275
276
277
278
279
280
281
282
283
284
285
286
287
288
289
290
291
292
293
294
295
296
297
298
299
300
301
302
303
304
305
306
307
308
309
310
311
312
313
314
315
316
317
318
319
320
321
322
323
324
325
326
327
328
329
330
331
332
333
334
335
336
337
338
339
340
341
342
343
344
345
346
347
348
349
350
351
352
353
354
355
356
357
358
359
360
361
362
363
364
365
366
367
368
369
370
371
372
373
374
375
376
377
378
379
380
381
382
383
384
385
386
387
388
389
390
391
392
393
394
395
396
397
398
399
400
401
402
403
404
405
406
407
408
409
410
411
412
413
414
415
416
417
418
419
420
421
422
423
424
425
426
427
428
429
430
431
432
433
434
435
436
437
438
439
440
441
442
443
444
445
446
447
448
449
450
451
452
453
454
455
456
457
458
459
460
461
462
463
464
465
466
467
468
469
470
471
472
473
474
475
476
477
478
479
480
481
482
483
484
485
486
487
488
489
490
491
492
493
494
495
496
497
498
499
500
501
502
503
504
505
506
507
508
509
510
511
512
513
514
515
516
517
518
519
520
521
522
523
524
525
526
527
528
529
530
531
532
533
534
535
536
537
538
539
540
541
542
543
544
545
546
547
548
549
550
551
552
553
554
555
556
557
558
559
560
561
562
563
564
565
566
567
568
569
570
571
572
573
574
575
576
577
578
579
580
581
582
583
584
585
586
587
588
589
590
591
592
593
594
595
596
597
598
599
600
601
602
603
604
605
606
607
608
609
610
611
612
613
614
615
616
617
618
619
620
621
622
623
624
625
626
627
628
629
630
631
632
633
634
635
636
637
638
639
640
641
642
643
644
645
646
647
648
649
650
651
652
653
654
655
656
657
658
659
660
661
662
663
664
665
666
667
668
669
670
671
672
673
674
675
676
677
678
679
680
681
682
683
684
685
686
687
688
689
690
691
692
693
694
695
696
697
698
699
700
701
702
703
704
705
706
707
708
709
710
711
712
713
714
715
716
717
718
719
720
721
722
723
724
725
726
727
728
729
730
731
732
733
734
735
736
737
738
739
740
741
742
743
744
745
746
747
748
749
750
751
752
753
754
755
756
757
758
759
760
761
762
763
764
765
766
767
768
769
770
771
772
773
774
775
776
777
778
779
780
781
782
783
784
785
786
787
788
789
790
791
792
793
794
795
796
797
798
799
800
801
802
803
804
805
806
807
808
809
810
811
812
813
814
815
816
817
818
819
820
821
822
823
824
825
826
827
828
829
830
831
832
833
834
835
836
837
838
839
840
841
842
843
844
845
846
847
848
849
850
851
852
853
854
855
856
857
858
859
860
861
862
863
864
865
866
867
868
869
870
871
872
873
874
875
876
877
878
879
880
881
882
883
884
885
886
887
888
889
890
891
892
893
894
895
896
897
898
899
900
901
902
903
904
905
906
907
908
909
910
911
912
913
914
915
916
917
918
919
920
921
922
923
924
925
926
927
928
929
930
931
932
933
934
935
936
937
938
939
940
941
942
943
944
945
946
947
948
949
950
951
952
953
954
955
956
957
958
959
960
961
962
963
964
965
966
967
968
969
970
971
972
973
974
975
976
977
978
979
980
981
982
983
984
985
986
987
988
989
990
991
992
993
994
995
996
997
998
999
1000
---
title: "Точечные процессы"
subtitle: "Основы геоинформатики: лекция 11"
date: 04/19/2024
date-format: long
author: "Самсонов Тимофей Евгеньевич"
execute:
echo: false
message: false
freeze: true
engine: knitr
format:
revealjs:
theme: [default, custom_small.scss]
margin: 0.2
slide-number: true
footer: "Самсонов Т. Е. Основы геоинформатики: курс лекций"
header-includes: <link rel="stylesheet" media="screen" href="https://fontlibrary.org//face/pt-sans" type="text/css"/>
bibliography: references.yaml
mainfont: PT Sans
---
## Размещение
::: columns
::: {.column width="65%"}
**Размещение** объектов в пространстве может как быть случайным, так и подчиняться определенным закономерностям.
Модели размещения позволяют описать характер размещения в виде количественных статистических параметров.
::: callout-note
## Как это работает?
Например, плотность размещения деревьев можно связать с крутизной и экспозицией склона.
:::
:::
::: {.column width="35%"}
![](images/patterns.svg){width="100%"}
:::
:::
## Точечный процесс и паттерн
```{r}
library(tidyverse)
library(sf)
library(spatstat)
library(gganimate)
lambda = 300 # Интенсивность Пуассоновского процесса
k = 10 # Интенсивность кластеров
s = 0.04 # Ожидаемый размер кластера
m = 15 # Ожидаемое количество точек в кластере
r = 0.05 # Расстояние ингибиции (для регулярного процесса)
```
::: columns
::: {.column width="50%"}
**Точечный процесс** --- случайный процесс $\mathbf P$ , *реализациями* которого являются точечные паттерны.
**Точечный паттерн** --- неупоря-доченное множество точек:
$$\mathbf{p} = \{p_1, p_2,...p_n\}$$
Количество точек $n = n(\mathbf p)$ может быть любым неотрицательным числом.
:::
::: {.column width="50%"}
```{r, fig.width=4, fig.height=4}
adf = function(ppp) {
ppp$df = tibble(
x = ppp$x,
y = ppp$y
)
return(ppp)
}
nframes = 20
pois = lapply(1:nframes, \(iter) {
p = rpoispp(lambda)
tibble(
x = p$x,
y = p$y,
iter = iter
)
}) |> bind_rows()
gp = ggplot(pois, aes(x,y)) +
geom_point(size = 3, color = 'steelblue4') +
coord_equal() +
theme_void() +
transition_states(iter)
animate(gp, fps = 1, nframes = nframes,
rewind = TRUE, detail = 0, width = 480, height = 480)
```
:::
:::
## Эталонные распределения
Характер пространственного распределения устанавливается путем сравнения с **эталонными моделями** распределений.
::: columns
::: {.column width="50%"}
Распространены следующие эталонные распределения:
1. Абсолютно случайное
- однородное
- неоднородное
2. Кластерное
3. Регулярное
:::
::: {.column width="50%"}
::: callout-tip
## Экспериментальный подход
1. В пределах той же территории генерируется множество случайных паттернов, состоящих из того же числа точек.
2. Статистические характеристики случайных паттернов сравниваются с аналогичными характеристиками фактического распределения.
3. Делается вывод о том, к какому распределению принадлежит фактическое.
:::
:::
:::
## Абс. случайное распределение
::: columns
::: {.column width="55%"}
1. Координаты $X$ и $Y$ имеют равномерное распределение в заданной области $B$.
2. Ожидаемое количество точек, попадающих в регион $B$ пропорционально его площади:
$$
\mu = \mathbb E\big[n(\mathbf{P} \cap B)\big] = \lambda |B|,
$$
где $\lambda$ --- интенсивность.
:::
::: {.column width="45%"}
```{r yeah}
gp = ggplot() +
annotate('rect', xmin = 0.1, xmax = 0.7,
ymin = 0.2, ymax = 0.7, alpha = 0.5,
color = 'magenta', fill = 'pink') +
annotate("text", x = 0.4, y = 0.45,
label = "B", size = 20) +
geom_point(data = pois, mapping = aes(x,y),
size = 3, color = 'steelblue4') +
coord_equal() +
theme_bw() +
transition_states(iter)
animate(gp, fps = 1, nframes = nframes,
rewind = TRUE, detail = 0, width = 480, height = 480)
```
:::
:::
::: callout-tip
## Интенсивность
Интенсивность точечного процесса --- ожидаемое количество точек *на единицу площади*.
:::
## Абс. случайное распределение
::: columns
::: {.column width="55%"}
Вероятность того, что в области $B$ окажется ровно $k$ точек имеет распределение Пуассона $\Pi(\mu)$:
$$
\mathbb{P}\{N = k\} = e^{-\mu} \frac{\mu^k}{k!}
$$
::: callout-note
## Пуассоновский процесс
Абсолютно случайный точечный процесс также называют *пуассоновским*.
:::
:::
::: {.column width="45%"}
```{r, ref.label='yeah'}
```
:::
:::
::: callout-tip
## Однородный пуассоновский процесс
Пуассоновский процесс называется *однородным*, если его интенсивность не зависит от местоположения. То есть, $\lambda$ --- константа.
:::
## Симуляция Пуассоновского процесса
Пусть дана область $B = [x_{min}, x_{max}] \times [y_{min}, y_{max}]$ и интенсивность точечного процесса $\lambda$.
Необходимо сгенерировать:
1. Случайное число $N$, имеющее распределение Пуассона с параметром $\mu = \lambda |B|$.
2. $N$ координат $x_i = x_1, x_2, ..., x_N$, имеющих равномерное распределение на промежутке $[x_{min}, x_{max}]$.
3. $N$ координат $y_i = y_1, y_2, ..., y_N$, имеющих равномерное распределение на промежутке $[y_{min}, y_{max}]$.
Точечный паттерн $p_i = (x_i, y_i)$ собирается из полученных координат.
## Неоднородная случайность
::: columns
::: {.column width="55%"}
1. Неоднородный пуассоновский процесс имеет функцию интенсивности $\lambda(x,y)$, которая зависит от местоположения.
2. Ожидаемое количество точек в регионе $B$:
$$
\mu = \mathbb E\big[n(\mathbf{P} \cap B)\big] = \int_B \lambda(x,y) dx dy
$$
::: callout-note
## Процесс Кокса
Процесс Кокса --- неоднородный Пуассоновский процесс, в котором $\lambda$ --- случайная величина.
:::
:::
::: {.column width="45%"}
```{r}
hpois = lapply(1:nframes, \(iter) {
lambda = function(x,y) { 500 * (y^2 + x) }
p = rpoispp(lambda)
tibble(
x = p$x,
y = p$y,
iter = iter
)
}) |> bind_rows()
gp = ggplot() +
annotate('rect', xmin = 0.1, xmax = 0.7,
ymin = 0.2, ymax = 0.7, alpha = 0.5,
color = 'magenta', fill = 'pink') +
annotate("text", x = 0.4, y = 0.45,
label = "B", size = 20) +
geom_point(data = hpois, mapping = aes(x,y),
size = 3, color = 'steelblue4') +
coord_equal() +
theme_bw() +
transition_states(iter)
animate(gp, fps = 1, nframes = nframes,
rewind = TRUE, detail = 0, width = 480, height = 480)
```
$$
\lambda(x,y) = x + y^2
$$
:::
:::
## Симуляция неоднородного процесса
Метод *Льюиса-Шедлера* (Lewis-Shedler thinning):
1. Генерируется однородный Пуассоновской процесс с интенсивностью $\lambda_{max} = \max\big[\lambda(x, y)\big]$.
2. Осуществляется случайное прореживание (исключение) точек с вероятностью сохранения точки $\mathbb P(x,y) = \lambda(x,y) / \lambda_{max}$, пропорциональной функции интенсивности.
Чтобы понять, будет ли точка исключена, генерируется случайное число 0 или 1, имеющее распределение Бернулли с вероятностью положительного исхода $\mathbb P = \mathbb P(x,y)$.
## Граничный эффект
::: columns
::: {.column width="50%"}
**Центробежная** конфигурация (тяготеет к границе) может свидетельствовать о:
- влиянии объектов (границы) на конфигурацию точек
- наличии определенного ресурса у границы
- необходимости предотвращения выхода объектов другого типа за границу объекта или проникновения извне
:::
::: {.column width="50%"}
```{r}
border = lapply(1:nframes, \(iter) {
lambda = function(x,y) { 500 * ((y-0.5)^2 + (x-0.5)^2) }
p = rpoispp(lambda)
tibble(
x = p$x,
y = p$y,
iter = iter
)
}) |> bind_rows()
gp = ggplot() +
geom_point(data = border, mapping = aes(x,y),
size = 3, color = 'steelblue4') +
coord_equal() +
theme_bw() +
transition_states(iter)
animate(gp, fps = 1, nframes = nframes,
rewind = TRUE, detail = 0, width = 480, height = 480)
```
:::
:::
## Граничный эффект
::: columns
::: {.column width="50%"}
**Центростремительная** конфигурация (отталкивается от границы) может свидетельствовать о:
- неблагоприятности приграничных территорий для данного типа точек
- сосредоточении ресурсов в центральной части региона
:::
::: {.column width="50%"}
```{r}
center = lapply(1:nframes, \(iter) {
lambda = function(x,y) { 500 * (1.0 - abs(y-0.5) - abs(x-0.5)) }
p = rpoispp(lambda)
tibble(
x = p$x,
y = p$y,
iter = iter
)
}) |> bind_rows()
gp = ggplot() +
geom_point(data = center, mapping = aes(x,y),
size = 3, color = 'steelblue4') +
coord_equal() +
theme_bw() +
transition_states(iter)
animate(gp, fps = 1, nframes = nframes,
rewind = TRUE, detail = 0, width = 480, height = 480)
```
:::
:::
## Кластерное распределение
::: columns
::: {.column width="50%"}
**Кластерным** называется распределение, в котором точки имеют тенденцию образовывать скопления --- кластеры.
Точки из одного кластера в среднем значительно ближе, чем точки из разных кластеров.
::: callout-note
## Кластер
Объединение нескольких однородных элементов, которое может рассматриваться как самостоятельная единица, обладающая определёнными свойствами.
:::
:::
::: {.column width="50%"}
```{r}
matern = lapply(1:nframes, \(iter) {
p = rMatClust(k, s, m)
tibble(
x = p$x,
y = p$y,
iter = iter
)
}) |> bind_rows()
gp = ggplot() +
geom_point(data = matern, mapping = aes(x,y),
size = 3, color = 'steelblue4') +
coord_equal() +
theme_bw() +
transition_states(iter)
animate(gp, fps = 1, nframes = nframes,
rewind = TRUE, detail = 0, width = 480, height = 480)
```
:::
:::
## Кластерное распределение
Модели кластерных процессов работают в три этапа.
I. Генерируется "родительский" точечный процесс:
```{r}
parents = tibble(
x = runif(k),
y = runif(k)
)
ggplot() +
geom_point(data = parents, mapping = aes(x,y),
size = 5, color = 'red') +
coord_equal() +
xlim(0, 1) +
ylim(0, 1) +
theme_bw()
```
## Кластерное распределение
Модели кластерных процессов работают в три этапа.
II\. Относительно родителей генерируются потомки:
```{r}
dist = rnorm(m * k, 0, s)
theta = runif(m * k, 0, 2 * pi)
offspr = tibble(
x = rep(parents$x, m) + dist * cos(theta),
y = rep(parents$y, m) + dist * sin(theta)
)
ggplot() +
geom_point(data = offspr, mapping = aes(x,y),
size = 3, color = 'steelblue4') +
geom_point(data = parents, mapping = aes(x,y),
size = 5, color = 'red') +
coord_equal() +
xlim(0, 1) +
ylim(0, 1) +
theme_bw()
```
## Кластерное распределение
Модели кластерных процессов работают в три этапа.
III\. Родительские точки исключаются:
```{r}
ggplot() +
geom_point(data = offspr, mapping = aes(x,y),
size = 3, color = 'steelblue4') +
coord_equal() +
xlim(0, 1) +
ylim(0, 1) +
theme_bw()
```
## Кластерное распределение
Самая известная кластерная модель --- **Неймана-Скотта**:
1. Родительские точки --- Пуассоновский процесс.
2. Внутри каждого кластера потомки распределены независимо друг от друга.
3. Потомки из разных кластеров так же распределены независимо друг от друга
4. Закон распределения потомков относительно центра кластера одинаков для всех кластеров.
::: callout-note
## Модель Неймана-Скотта
Модель Неймана-Скотта была разработана для описания звёздных скоплений, но нашла широкое применение за пределами астрономии, в том числе в географическом анализе.
:::
## Генерация потомков
::: columns
::: {.column width="50%"}
**Процесс Матерна** $(\kappa, \mu, r)$
```{r, fig.height=5, fig.width=5, fig.align='left'}
p = rMatClust(k*2, s * 1.5, m * 5)
matern = tibble(
x = p$x,
y = p$y
)
ggplot() +
geom_point(data = matern, mapping = aes(x,y),
size = 1, color = 'blue', alpha = 0.25) +
ggtitle("Равномерное распределение расстояний") +
coord_equal() +
xlim(0, 1) +
ylim(0, 1) +
theme_bw()
```
:::
::: {.column width="50%"}
$\Pi(\mu)$ случайных точек, *равномерно* распределенных в радиусе $r$ относительно $\Pi(\kappa)$ родительских точек
- Потомки образуют *однородные* Пуассоновские процессы в окрестностях родителей.
- У полученных кластеров четкие края — за пределами радиуса $r$ потомков не бывает. По этой причине процесс также называется *hardcore*.
:::
:::
## Генерация потомков
::: columns
::: {.column width="50%"}
**Процесс Томаса** $(\kappa, \mu, \sigma)$
```{r, fig.height=5, fig.width=5, fig.align='left'}
p = rThomas(k*2, s * 0.75, m * 5)
thomas = tibble(
x = p$x,
y = p$y
)
ggplot() +
geom_point(data = thomas, mapping = aes(x,y),
size = 1, color = 'red', alpha = 0.25) +
ggtitle("Нормальное распределение расстояний") +
coord_equal() +
xlim(0, 1) +
ylim(0, 1) +
theme_bw()
```
:::
::: {.column width="50%"}
$\Pi(\mu)$ случайных точек, расстояния которых относительно $\Pi(\kappa)$ родительских точек распределены по нормальному закону $N(0, \sigma^2)$
- Потомки образуют *неоднородные* Пуассоновские процессы — их плотность выше вблизи родителей
- У полученных кластеров мягкие края — параметр $\sigma$ определяет лишь среднеквадратическое отклонение расстояний
:::
:::
## Регулярное распределение
::: columns
::: {.column width="55%"}
**Регулярным** называется случайное распределение, при котором точки не могут располагаться ближе чем $r$ --- *расстояние* *ингибиции*.
::: callout-caution
## Регулярное ≠ равномерное
Не следует путать регулярное распределение с равномерным. Равномерность означает постоянную плотность распределения.
:::
:::
::: {.column width="45%"}
```{r, fig.width=4, fig.height=4}
ssi = lapply(1:nframes, \(iter) {
p = rSSI(r, lambda)
tibble(
x = p$x,
y = p$y,
iter = iter
)
}) |> bind_rows()
gp = ggplot(ssi, aes(x,y)) +
geom_point(size = 4, color = 'steelblue4', alpha = 0.5) +
coord_equal() +
theme_bw() +
transition_states(iter)
animate(gp, fps = 1, nframes = nframes,
rewind = TRUE, detail = 0, width = 400, height = 400)
```
:::
:::
::: callout-tip
## Причины
Регулярность распределения обычно свидетельствует о конкуренции за пространство и часто встречается в животном мире.
:::
## Генерация регулярного паттерна
::: columns
::: {.column width="50%"}
**Последовательная** модель:
- генерировать абсолютно случайные (пуассоновские) точки по одной;
- каждую последующую сохранять, если она находится на расстоянии не ближе $r$ от сохраненных ранее.
:::
::: {.column width="50%"}
```{r}
ssi_1 = ssi |>
filter(iter == 1) |>
mutate(num = row_number())
gp = ggplot(ssi_1, aes(x,y)) +
geom_point(size = 4, color = 'steelblue4', alpha = 0.5) +
coord_equal() +
theme_bw() +
transition_manual(num, cumulative = T)
animate(gp, nframes = gp$num, detail = 0, width = 400, height = 400)
```
:::
:::
::: callout-warning
## Внимание
Процесс может не завершиться, если при высокой интенсивности задано также слишком большое расстояние ингибиции. В этом случае будет недостаточно места для размещения ожидаемого числа точек.
:::
## Диагностика распределений
Выявление типа распределения осуществляется на основе статистических тестов применительно к свойствам двух типов
::: columns
::: {.column width="50%"}
#### Свойства I порядка
Оценивается *интенсивность* точечного процесса $\lambda$ , ее статистическое распределение
- плотность пространственного распределения;
- количество точек по ячейкам регулярной сетки.
:::
::: {.column width="50%"}
#### Свойства II порядка
Оцениваются *расстояния* между точками, их статистическое распределение
- расстояние до ближайшего соседа;
- расстояние до $K$ ближайших соседей (функция Рипли).
:::
:::
## Плотность распределения
Оценка плотности пространственного распределения делается методом **ядерного сглаживания**.
Над каждой точкой позиционируется *ядро* --- мини-поверхность:
![](images/density_1.svg){width="100%"}
## Плотность распределения
Оценка плотности пространственного распределения делается методом **ядерного сглаживания**.
*Сумма* поверхностей дает оценку плотности в точке:
![](images/density_2.svg){width="100%"}
## Плотность распределения
::: columns
::: {.column width="50%"}
**Однородный пуассоновский**
```{r, fig.width=5, fig.height=5}
pat = filter(pois, iter == 1)
ggplot(pat, aes(x,y)) +
geom_density_2d_filled() +
geom_density_2d(linewidth = 0.25, colour = "black") +
geom_point(alpha = 0.5) +
coord_equal() +
guides(fill = guide_legend(override.aes = list(size = 0.5))) +
theme(legend.title = element_text(size = 7),
legend.text = element_text(size = 7))
```
:::
::: {.column width="50%"}
**Неоднородный пуассоновский**
```{r, fig.width=5, fig.height=5}
pat = filter(hpois, iter == 1)
ggplot(pat, aes(x,y)) +
geom_density_2d_filled() +
geom_density_2d(linewidth = 0.25, colour = "black") +
geom_point(alpha = 0.5) +
coord_equal() +
guides(fill = guide_legend(override.aes = list(size = 0.5))) +
theme(legend.title = element_text(size = 7),
legend.text = element_text(size = 7))
```
:::
:::
## Плотность распределения
::: columns
::: {.column width="50%"}
**Кластерный Матерна**
```{r, fig.width=5, fig.height=5}
ggplot(matern, aes(x,y)) +
geom_density_2d_filled() +
geom_point(alpha = 0.25) +
geom_density_2d(linewidth = 0.25, colour = "black") +
coord_equal() +
guides(fill = guide_legend(override.aes = list(size = 0.5))) +
theme(legend.title = element_text(size = 7),
legend.text = element_text(size = 7))
```
:::
::: {.column width="50%"}
**Кластерный Томаса**
```{r, fig.width=5, fig.height=5}
ggplot(thomas, aes(x,y)) +
geom_density_2d_filled() +
geom_point(alpha = 0.25) +
geom_density_2d(linewidth = 0.25, colour = "black") +
coord_equal() +
guides(fill = guide_legend(override.aes = list(size = 0.5))) +
theme(legend.title = element_text(size = 7),
legend.text = element_text(size = 7))
```
:::
:::
## Плотность распределения
::: columns
::: {.column width="50%"}
**Диагностика плотности**
1. Чем выше разброс значений плотности распределения, тем сильнее оно отличается от регулярного.
2. При оценке плотности могут возникать краевые эффекты, связанные с тем, что вблизи границ располагается меньшее число точек
:::
::: {.column width="50%"}
**Регулярный**
```{r, fig.width=5, fig.height=5}
ggplot(ssi_1, aes(x,y)) +
geom_density_2d_filled() +
geom_point(alpha = 0.25) +
geom_density_2d(linewidth = 0.25, colour = "black") +
coord_equal() +
guides(fill = guide_legend(override.aes = list(size = 0.5))) +
theme(legend.title = element_text(size = 7),
legend.text = element_text(size = 7))
```
:::
:::
## G-функция
$G$**-функция** --- эмпирическая функция распределения расстояний до ближайшего соседа:
$$
G(r) = \frac{1}{n}\sum_{i=1}^n \big[r_{min}(p_i) < r \big],
$$
- $r_{min}$ --- расстояние от $p_i$ до ближайшей к ней точки.
- $[~\circ~]$ --- индикаторная функция, принимающая значения:
- $1$, если $\circ = ИСТИНА$,
- $0$, если $\circ = ЛОЖЬ$.
## G-функция
Чтобы понять тип распределения, необходимо сравнить $G$-функцию для фактического распределения с $G$-функцией, которую имел бы абсолютно случайный паттерн на той же территории при том же количестве точек
1. По фактическим данным оценивается интенсивность процесса $\lambda$.
2. Осуществляется множество симуляций пуассоновского процесса с интенсивностью $\lambda$.
3. Для каждого значения $r$ находят среднюю величину $G(r)$, а также разброс $\pm 3\sigma$ по множеству симуляций.
4. Полученные значения дают оценку ожидаемой $G$-функции и ее доверительного интервала для случайного распределения.
## G-функция
::: columns
::: {.column width="40%"}
**Абсолютно случайное** распределение
График фактического распределения $\widehat G_{obs} (r)$ находится в пределах доверительного интервала относительно теоретического распределения $G_{theo}(r)$.
Достоверных отличий нет.
:::
::: {.column width="60%"}
```{r, fig.width=5, fig.height=5, out.width='100%'}
pat = rpoispp(lambda)
rad = 0.005 * 0:200
G = envelope(pat, Gest, r = rad, nsim = 100, verbose=FALSE)
plot(G, xlim = c(0, 0.15), main = NULL)
```
:::
:::
## G-функция
::: columns
::: {.column width="40%"}
**Кластерное** распределение
График фактического распределения $\widehat G_{obs} (r)$ находится ***над*** графиком теоретического распределения $G_{theo}(r)$.
Малые расстояния встречаются *чаще*, чем в пуассоновском процессе.
:::
::: {.column width="60%"}
```{r, fig.width=5, fig.height=5, out.width='100%'}
pat = rMatClust(k, s, m)
rad = 0.005 * 0:200
G = envelope(pat, Gest, r = rad, nsim = 100, verbose=FALSE)
plot(G, xlim = c(0, 0.15), main = NULL)
```
:::
:::
## G-функция
::: columns
::: {.column width="40%"}
**Регулярное** распределение
График фактического распределения $\widehat G_{obs} (r)$ находится ***под*** графиком теоретического распределения $G_{theo}(r)$.
Малые расстояния встречаются *реже*, чем в пуассоновском процессе.
:::
::: {.column width="60%"}
```{r, fig.width=5, fig.height=5, out.width='100%'}
pat = rSSI(r, lambda)
rad = 0.005 * 0:200
G = envelope(pat, Gest, r = rad, nsim = 100, verbose=FALSE)
plot(G, xlim = c(0, 0.15), main = NULL)
```
:::
:::
## Пример
Рассмотрим данные по расположению деревьев во влажном тропическом лесу:
```{r, fig.align='left'}
data(bei)
beidf = tibble(
x = bei$x,
y = bei$y
)
ggplot(beidf, aes(x,y)) +
geom_point(color = 'darkgreen', alpha = 0.5) +
coord_equal() +
theme_bw()
```
## Плотность распределения
Характер плотности пространственного распределения говорит о неоднородном Пуассоновском процессе
```{r}
ggplot(beidf, aes(x,y)) +
geom_density_2d_filled() +
geom_density_2d(linewidth = 0.25, colour = "black") +
geom_point(alpha = 0.5) +
coord_equal() +
guides(fill = guide_legend(override.aes = list(size = 0.5))) +
theme(legend.title = element_text(size = 7),
legend.text = element_text(size = 7)) +
theme_bw()
```
## G-функция
Характер G-функции говорит о неоднородном Пуассоновском либо кластерном процессе
```{r, fig.width=10, fig.height=5, out.width='100%'}
rad = 0:200
G = envelope(bei, Gest, r = rad, nsim = 100, verbose=FALSE)
plot(G, xlim = c(0, 20), main = NULL)
```
## Высота рельефа
Можно связать функцию интенсивности с *ковариатами* --- внешними факторами, такими как высота и уклон рельефа.
```{r, fig.height=7, fig.width=12, fig.align='left'}
data(bei.extra)
elev = bei.extra[[1]] # высота
grad = bei.extra[[2]] # градиент (уклон)
plot(elev, main = NULL)
plot(bei, add = TRUE)
```
## Уклон
Можно связать функцию интенсивности с *ковариатами* --- внешними факторами, такими как высота и уклон рельефа.
```{r, fig.height=7, fig.width=12, fig.align='left'}
plot(grad, main = NULL)
plot(bei, add = TRUE)
```
## Оценка интенсивности
**Интенсивность процесса** как функция от уклона
```{r, fig.height=7, fig.width=12, fig.align='left'}
model = ppm(bei ~ offset(log(grad)), data = bei.extra)
plot(model, how = "image", se = FALSE, main = NULL)
```
## Моделирование
**Методом Льюиса-Шедлера** можно смоделировать альтернативные конфигурации неоднородного процесса:
```{r, fig.height=7, fig.width=12, fig.align='left'}
sim = simulate(model)
plot(elev, main = NULL)
plot(sim[[1]], col = 'black', cex = 0.5, add = TRUE)
```
## Моделирование
**Методом Льюиса-Шедлера** можно смоделировать альтернативные конфигурации неоднородного процесса:
```{r, fig.height=7, fig.width=12, fig.align='left'}
sim = simulate(model)
plot(elev, main = NULL)
plot(sim[[1]], col = 'black', cex = 0.5, add = TRUE)
```
## Моделирование
**Методом Льюиса-Шедлера** можно смоделировать альтернативные конфигурации неоднородного процесса:
```{r, fig.height=7, fig.width=12, fig.align='left'}
sim = simulate(model)
plot(elev, main = NULL)
plot(sim[[1]], col = 'black', cex = 0.5, add = TRUE)
```
## Моделирование
**Методом Льюиса-Шедлера** можно смоделировать альтернативные конфигурации неоднородного процесса:
```{r, fig.height=7, fig.width=12, fig.align='left'}
sim = simulate(model)
plot(elev, main = NULL)
plot(sim[[1]], col = 'black', cex = 0.5, add = TRUE)
```
## Моделирование
**Методом Льюиса-Шедлера** можно смоделировать альтернативные конфигурации неоднородного процесса:
```{r, fig.height=7, fig.width=12, fig.align='left'}
sim = simulate(model)
plot(elev, main = NULL)
plot(sim[[1]], col = 'black', cex = 0.5, add = TRUE)
```
## Направления использования
Некоторые примеры географических явлений и систем, для анализа которых будет полезен инструментарий точечных процессов:
1. Размещение населенных пунктов и объектов сферы услуг.
2. Местоположение средств передвижения (авто, самокат) и абонентов сотовой сети.
3. Особенности пространственного распределения представителей растительного и животного мира (норы, гнезда и т.д.)
4. Плотность распределения форм рельефа и термокарстовых озер, их упорядоченность на местности.
5. Месторождения и их связь с геологическими линеаментами.
6. Точечный трекинг циклонов и дрейфующих буев.
## Словарик
::: columns
::: {.column width="50%" style="color: blue; text-align: end;"}
Случайный процесс
Точечный процесс
Точечный паттерн
Пуассоновский процесс
Неоднородный процесс
Кластерный процесс
Регулярный процесс
Плотность простр. распред.
Ядерное сглаживание
Эмпирическая функция распределения
:::
::: {.column width="50%" style="color: red"}
Random process
Point process
Point pattern