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gdemare authored Dec 20, 2024
1 parent 818e897 commit c27c610
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132 changes: 20 additions & 112 deletions docs/biologie/technique/imagerie/microscopie.md
Original file line number Diff line number Diff line change
@@ -1,45 +1,10 @@
[[ordres de grandeur]]
Source photons ou électron.
### Optique ou photonique

### Electronique
Il existe deux grands types de microscopie :

Il existe deux grands types de microscope électronique :

* Transmission révèle l'ultrastructure.
* Balayage révèle le relief d'une surface. La mesure les angles de réfection des électrons

Généralement en ajout des métaux lourds pour augmenter la

Électronique :

* Résolution importante
* Ultra structure visible distingue les organites
* Les électrons traversent la coupe
* Noir/blanc
## Les schémas

Un schéma doit contenir :

* Titre
* Phylogénie
* Grossissement et échelle
### Le titre

Le titre doit contenir les éléments suivants :

* Type de dessin
* Le sujet dessiné
* L'espèce observé entre parenthèse et soulignée
* L'outils utilisé pour l'observation (microscope, à l'œil nu...)
* Le type de préparation utilisé (commercial ou personnel)
* L'utilisation d'une coloration (coloration au ...)
* Dans un cadre, mettre la phylogénie.

!!! example
Dessin d'observation d'une cellule d'Elodée (Elodea canadensis) au microscope optique. Préparation personnelle avec coloration.

Dans un cadre, mettre l'ensemble des rangs taxonomiques et souligner l'espèce.
- optique (ou photonique)
- électronique.

### Calcul du grossissement

Expand Down Expand Up @@ -83,28 +48,6 @@ L'échelle est la correspondance entre 1 centimètre sur le dessin et la taille

$Échelle = \frac{1 cm}{taille du dessin} \ times taille réel du sujet$

### Microscopie optique

Pour rappel, la lumière est un phénomène électrique et magnétique et dans un système l'énergie ne peut que diminuer.

!!! note
Le verre et l'huile ont souvent un n proche.

Polariser filtrer une lumière en fonction de l'angle d'incidence des ondes.

Microscope est un appareil composé :

* D'un objectif qui sert à
* D'un oculaire qui sert à corriger les aberrations.

Les aberrations sont dû au fait que la fréquence des ondes lumineuses a une incidence sur l'angle de réfraction lors d'un changement de milieu. Cela donne lieu au phénomène de diffraction.

__Diffraction__ phénomène d'étalement de la lumière.

__Ouverture numérique__ l'angle d'écart et la quantité de réfraction.

L'indice de réfraction est une mesure l'atténuation de l'onde dans le milieu.

### Résolution

La limite de résolution correspond à la mesure de la diffraction du système optique.
Expand Down Expand Up @@ -134,67 +77,32 @@ La résolution dépend :

!!! note
La microscopie électronique permet une meilleure résolution car la longueur d'onde des électrons est beaucoup plus faible que celle de la lumière.

### Enregistrement d'une image

Dans le cas d'une image numérique, il faut déterminer la résolution optimale pour enregistrer une image. Il faut à la fois conserver le plus d'information limitant la taille du fichier.

Le meilleur compris est d'enregistrer avec une résolution de l'appareil pour chaque image.

## Champs sombre et contraste de phase

Le principe est de modifier la façon dont on éclaire l'échantillon pour visualiser les détails.

Contraste augmenter utilisation de la réfraction différente en fonction de la composition de l'échantillon.

Phase propriété d'addition et de soustraction des longueurs d'onde.

Un anneau lumineux éclaire l'échantillon.

Fonction d'un microscope spectre d'absorbance

Peu fluorescence + exemple critère du choix

Technique micro

Microscopie a fluorescence à champ large

Réponse au problème d'une nombre trop faible d'émission de fluochrome

Eclair et capte la lumière sur une épaisseur de l'échantillons.

Déconvolution pour rendre l'image net. Traitement numérique.

Microscopie confocale

L'échantillon est éclairé de façon graduelle.

Photoblanchiment perte de la faculté d'une molécule à être fluorescente. Elle se produit pour donner suite à la l'oxydation.

Utilisé pour suivre la cinétique en créant une zone bleacher comme référence.

# Fluorescence

* Luminescence par l'excitation des électrons d'un atome. On parle de fluorescence si le temps de démission d'un nouveau photon est « instantané » et sinon de phosphorescence.
* Incandescence par la chaleur (agitation thermique).
* Électroluminescence par le passage d'un courant d'électrons.
* Radioluminescence.
* Chimiluminescence lorsque le photon est produit au cours d'une réaction chimique (dont la bioluminescence de la luciférase).

De nombreux paramètre influence le rendement et l'efficacité du fluorochrome (polarité, ph, ions, liaison OH, pression, viscosité, T°, inhibiteurs, potentiel électrique).

Polarité un solvant faiblement polaire à tendance à diminuer la longueur d'onde d'émission.

En augmentant la viscosité, on limite la dégradation du fluorochrome.
## Les schémas

Fonction d'étalement du point correction informatique.
Un schéma doit contenir :

Confocal illumination de l'échantillon par laser. Précision de la zone éclairée. Modifie la façon dont l'échantillon est éclairé.
* Titre
* Phylogénie
* Grossissement et échelle
### Le titre

Déterminer la bonne dimension d'une image pour limiter la perte de donner lorsqu'il y a une conversion en binaire (enregistrer en format informatique).
Le titre doit contenir les éléments suivants :

L'idée est de
* Type de dessin
* Le sujet dessiné
* L'espèce observé entre parenthèse et soulignée
* L'outils utilisé pour l'observation (microscope, à l'œil nu...)
* Le type de préparation utilisé (commercial ou personnel)
* L'utilisation d'une coloration (coloration au ...)
* Dans un cadre, mettre la phylogénie.

Résolution x grossissement
!!! example
Dessin d'observation d'une cellule d'Elodée (Elodea canadensis) au microscope optique. Préparation personnelle avec coloration.

Résolution maximale au double de celle du système d'acquisition.
Dans un cadre, mettre l'ensemble des rangs taxonomiques et souligner l'espèce.

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