forked from PacificBiosciences/trgt
-
Notifications
You must be signed in to change notification settings - Fork 0
/
Copy pathpathogenic_repeats.hg38.bed
57 lines (57 loc) · 3.43 KB
/
pathogenic_repeats.hg38.bed
1
2
3
4
5
6
7
8
9
10
11
12
13
14
15
16
17
18
19
20
21
22
23
24
25
26
27
28
29
30
31
32
33
34
35
36
37
38
39
40
41
42
43
44
45
46
47
48
49
50
51
52
53
54
55
56
57
chr1 57367043 57367119 ID=DAB1;MOTIFS=AAAAT,GAAAT;STRUC=<DAB1>
chr1 146228800 146228821 ID=NOTCH2NLA;MOTIFS=GCC;STRUC=(GCC)n
chr1 149390802 149390841 ID=NOTCH2NLC;MOTIFS=GGC;STRUC=(GGC)n
chr10 79826383 79826404 ID=NUTM2B-AS1;MOTIFS=CGG;STRUC=(CGG)n
chr10 93702522 93702547 ID=FRA10AC1;MOTIFS=CCG;STRUC=(CCG)n
chr11 66744821 66744850 ID=C11ORF80;MOTIFS=GCG;STRUC=(GCG)n
chr11 119206289 119206322 ID=CBL;MOTIFS=CGG;STRUC=(CGG)n
chr12 6936716 6936773 ID=ATN1;MOTIFS=CAG;STRUC=(CAG)n
chr12 50505001 50505022 ID=DIP2B;MOTIFS=GGC;STRUC=(GGC)n
chr12 111598949 111599018 ID=ATXN2;MOTIFS=GCT;STRUC=(GCT)n
chr13 70139353 70139428 ID=ATXN8;MOTIFS=CTA,CTG;STRUC=(CTA)n(CTG)n
chr13 99985448 99985494 ID=ZIC2;MOTIFS=GCN;STRUC=(GCN)n
chr14 23321472 23321490 ID=PABPN1;MOTIFS=GCG;STRUC=(GCG)n
chr14 92071009 92071042 ID=ATXN3;MOTIFS=GCT;STRUC=(GCT)n
chr15 22786677 22786701 ID=NIPA1;MOTIFS=GCG;STRUC=(GCG)n
chr16 17470907 17470923 ID=XYLT1;MOTIFS=GCC;STRUC=(GCC)n
chr16 24613439 24613530 ID=TNRC6A;MOTIFS=TTTTA,TTTCA;STRUC=<TNRC6A>
chr16 66490398 66490467 ID=BEAN1;MOTIFS=TGGAA,TAAAA;STRUC=<BEAN1>
chr16 87604287 87604329 ID=JPH3;MOTIFS=CTG;STRUC=(CTG)n
chr18 55586155 55586227 ID=TCF4;MOTIFS=CAG;STRUC=(CAG)n
chr19 13207858 13207897 ID=CACNA1A;MOTIFS=CTG;STRUC=(CTG)n
chr19 14496041 14496074 ID=GIPC1;MOTIFS=CCG;STRUC=(CCG)n
chr19 18786034 18786050 ID=COMP;MOTIFS=GTC;STRUC=(GTC)n
chr19 45770204 45770264 ID=DMPK;MOTIFS=CAG;STRUC=(CAG)n
chr2 96197066 96197122 ID=STARD7;MOTIFS=TGAAA,TAAAA;STRUC=<STARD7>
chr2 100104799 100104824 ID=AFF3;MOTIFS=GCC;STRUC=(GCC)n
chr2 176093058 176093104 ID=HOXD13;MOTIFS=GCN;STRUC=(GCN)n
chr2 190880872 190880920 ID=GLS;MOTIFS=GCA;STRUC=(GCA)n
chr20 2652733 2652775 ID=NOP56;MOTIFS=GGCCTG,CGCCTG;STRUC=(GGCCTG)n(CGCCTG)n
chr21 43776443 43776479 ID=CSTB;MOTIFS=CGCGGGGCGGGG;STRUC=(CGCGGGGCGGGG)n
chr22 45795354 45795424 ID=ATXN10;MOTIFS=ATTCT;STRUC=(ATTCT)n
chr3 63912684 63912726 ID=ATXN7;MOTIFS=GCA,GCC;STRUC=(GCA)n(GCC)n
chr3 129172576 129172732 ID=CNBP;MOTIFS=CAGG,CAGA,CA;STRUC=<CNBP>
chr3 138946020 138946063 ID=FOXL2;MOTIFS=NGC;STRUC=(NGC)n
chr3 183712187 183712223 ID=YEATS2;MOTIFS=TTTTA,TTTCA;STRUC=<YEATS2>
chr4 3074876 3074966 ID=HTT;MOTIFS=CAG,CCG;STRUC=(CAG)nCAACAG(CCG)n
chr4 39348424 39348479 ID=RFC1;MOTIFS=AAAAG,AAAGG,AAGGG,AAGAG,AGAGG,AACGG,GGGAC,AAAGGG,CAGGA,CAAGA;STRUC=<RFC1>
chr4 41745972 41746032 ID=PHOX2B;MOTIFS=GCN;STRUC=(GCN)n
chr4 159342526 159342617 ID=RAPGEF2;MOTIFS=TTTTA,TTTCA;STRUC=<RAPGEF2>
chr5 10356346 10356412 ID=MARCHF6;MOTIFS=TTTTA,TTTCA;STRUC=<MARCHF6>
chr5 146878727 146878757 ID=PPP2R2B;MOTIFS=GCT;STRUC=(GCT)n
chr6 16327633 16327723 ID=ATXN1;MOTIFS=TGC;STRUC=(TGC)n
chr6 45422750 45422802 ID=RUNX2;MOTIFS=GCN;STRUC=(GCN)n
chr6 170561906 170562017 ID=TBP;MOTIFS=GCA;STRUC=(GCA)n
chr7 27199825 27199862 ID=HOXA13;MOTIFS=NGC;STRUC=(NGC)n
chr7 55887601 55887640 ID=ZNF713;MOTIFS=CGG;STRUC=(CGG)n
chr8 104588972 104589000 ID=LRP12;MOTIFS=CCG;STRUC=(CCG)n
chr8 118366815 118366919 ID=SAMD12;MOTIFS=TGAAA,TAAAA;STRUC=(TGAAA)n(TAAAA)n
chr9 27573528 27573546 ID=C9ORF72;MOTIFS=GGCCCC;STRUC=(GGCCCC)n
chr9 69037261 69037304 ID=FXN;MOTIFS=A,GAA;STRUC=(A)n(GAA)n
chrX 25013649 25013698 ID=ARX;MOTIFS=GCG;STRUC=(GCG)n
chrX 67545316 67545385 ID=AR;MOTIFS=GCA;STRUC=(GCA)n
chrX 140504316 140504362 ID=SOX3;MOTIFS=NGC;STRUC=(NGC)n
chrX 147912050 147912110 ID=FMR1;MOTIFS=CGG;STRUC=(CGG)n
chrX 148500631 148500691 ID=AFF2;MOTIFS=GCC;STRUC=(GCC)n
chrX 149631763 149631782 ID=TMEM185A;MOTIFS=GCC;STRUC=(GCC)n
chr13 102161576 102161726 ID=FGF14;MOTIFS=GAA;STRUC=(GAA)n