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monarch-initiative · Mar 30, 2023 · fa1c8a7 · fa1c8a7
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diff --git a/docs/metrics/doid.md b/docs/metrics/doid.md
@@ -2,7 +2,7 @@
 
 **IRI:** http://purl.obolibrary.org/obo/mondo/sources/doid.owl
 
-**Version IRI:** http://purl.obolibrary.org/obo/mondo/sources/2023-03-28/doid.owl
+**Version IRI:** http://purl.obolibrary.org/obo/mondo/sources/2023-03-29/doid.owl
 
 ### Entities and axioms
 

diff --git a/docs/metrics/icd10cm.md b/docs/metrics/icd10cm.md
@@ -2,7 +2,7 @@
 
 **IRI:** http://purl.obolibrary.org/obo/mondo/sources/icd10cm.owl
 
-**Version IRI:** http://purl.obolibrary.org/obo/mondo/sources/2023-03-28/icd10cm.owl
+**Version IRI:** http://purl.obolibrary.org/obo/mondo/sources/2023-03-29/icd10cm.owl
 
 ### Entities and axioms
 

diff --git a/docs/metrics/icd10who.md b/docs/metrics/icd10who.md
@@ -2,7 +2,7 @@
 
 **IRI:** http://purl.obolibrary.org/obo/mondo/sources/icd10who.owl
 
-**Version IRI:** http://purl.obolibrary.org/obo/mondo/sources/2023-03-28/icd10who.owl
+**Version IRI:** http://purl.obolibrary.org/obo/mondo/sources/2023-03-29/icd10who.owl
 
 ### Entities and axioms
 

diff --git a/docs/metrics/ncit.md b/docs/metrics/ncit.md
@@ -2,7 +2,7 @@
 
 **IRI:** http://purl.obolibrary.org/obo/mondo/sources/ncit.owl
 
-**Version IRI:** http://purl.obolibrary.org/obo/mondo/sources/2023-03-28/ncit.owl
+**Version IRI:** http://purl.obolibrary.org/obo/mondo/sources/2023-03-29/ncit.owl
 
 ### Entities and axioms
 

diff --git a/docs/metrics/omim.md b/docs/metrics/omim.md
@@ -2,7 +2,7 @@
 
 **IRI:** http://purl.obolibrary.org/obo/mondo/sources/omim.owl
 
-**Version IRI:** http://purl.obolibrary.org/obo/mondo/sources/2023-03-28/omim.owl
+**Version IRI:** http://purl.obolibrary.org/obo/mondo/sources/2023-03-29/omim.owl
 
 ### Entities and axioms
 

diff --git a/docs/metrics/ordo.md b/docs/metrics/ordo.md
@@ -2,7 +2,7 @@
 
 **IRI:** http://purl.obolibrary.org/obo/mondo/sources/ordo.owl
 
-**Version IRI:** http://purl.obolibrary.org/obo/mondo/sources/2023-03-28/ordo.owl
+**Version IRI:** http://purl.obolibrary.org/obo/mondo/sources/2023-03-29/ordo.owl
 
 ### Entities and axioms
 

diff --git a/docs/reports/mapped_deprecated.md b/docs/reports/mapped_deprecated.md
@@ -1,8 +1,8 @@
 # Mapped deprecated terms
 | Ontology                                    |   Tot deprecated in Mondo |
 |:--------------------------------------------|--------------------------:|
-| [OMIM](./mapped_deprecated_omim.md)         |                        98 |
-| [ORDO](./mapped_deprecated_ordo.md)         |                       620 |
+| [ORDO](./mapped_deprecated_ordo.md)         |                       574 |
+| [OMIM](./mapped_deprecated_omim.md)         |                        47 |
 | [NCIT](./mapped_deprecated_ncit.md)         |                        33 |
 | [DOID](./mapped_deprecated_doid.md)         |                        26 |
 | [ICD10WHO](./mapped_deprecated_icd10who.md) |                         0 |

diff --git a/docs/reports/mapped_deprecated_omim.md b/docs/reports/mapped_deprecated_omim.md
@@ -5,99 +5,48 @@
 | ID            | ID          | A oboInOwl:source        |
 | MONDO:0000911 | OMIM:613740 | MONDO:equivalentObsolete |
 | MONDO:0007061 | OMIM:102590 | MONDO:equivalentObsolete |
-| MONDO:0007418 | OMIM:124400 | MONDO:equivalentObsolete |
 | MONDO:0007602 | OMIM:134700 | MONDO:equivalentObsolete |
-| MONDO:0007617 | OMIM:609943 | MONDO:equivalentObsolete |
-| MONDO:0007617 | OMIM:614562 | MONDO:equivalentObsolete |
 | MONDO:0007659 | OMIM:137560 | MONDO:equivalentObsolete |
-| MONDO:0007779 | OMIM:145410 | MONDO:equivalentObsolete |
 | MONDO:0007801 | OMIM:146400 | MONDO:equivalentObsolete |
-| MONDO:0007818 | OMIM:146840 | MONDO:equivalentObsolete |
-| MONDO:0007903 | OMIM:609266 | MONDO:equivalentObsolete |
 | MONDO:0008074 | OMIM:162020 | MONDO:equivalentObsolete |
 | MONDO:0008091 | OMIM:162820 | MONDO:equivalentObsolete |
 | MONDO:0008126 | OMIM:164891 | MONDO:equivalentObsolete |
 | MONDO:0008204 | OMIM:168850 | MONDO:equivalentObsolete |
-| MONDO:0008289 | OMIM:607595 | MONDO:equivalentObsolete |
 | MONDO:0008409 | OMIM:181430 | MONDO:equivalentObsolete |
 | MONDO:0008415 | OMIM:181515 | MONDO:equivalentObsolete |
 | MONDO:0008448 | OMIM:182920 | MONDO:equivalentObsolete |
-| MONDO:0008490 | OMIM:277610 | MONDO:equivalentObsolete |
-| MONDO:0008523 | OMIM:609464 | MONDO:equivalentObsolete |
-| MONDO:0008774 | OMIM:245130 | MONDO:equivalentObsolete |
-| MONDO:0008885 | OMIM:603463 | MONDO:equivalentObsolete |
-| MONDO:0009194 | OMIM:614894 | MONDO:equivalentObsolete |
-| MONDO:0009302 | OMIM:233430 | MONDO:equivalentObsolete |
-| MONDO:0009307 | OMIM:233670 | MONDO:equivalentObsolete |
 | MONDO:0009535 | OMIM:247440 | MONDO:equivalentObsolete |
 | MONDO:0009654 | OMIM:252700 | MONDO:equivalentObsolete |
-| MONDO:0009679 | OMIM:253900 | MONDO:equivalentObsolete |
 | MONDO:0010045 | OMIM:270710 | MONDO:equivalentObsolete |
-| MONDO:0010205 | OMIM:278100 | MONDO:equivalentObsolete |
-| MONDO:0010258 | OMIM:300987 | MONDO:equivalentObsolete |
 | MONDO:0010291 | OMIM:300274 | MONDO:equivalentObsolete |
-| MONDO:0010295 | OMIM:300301 | MONDO:equivalentObsolete |
-| MONDO:0010327 | OMIM:300220 | MONDO:equivalentObsolete |
 | MONDO:0010340 | OMIM:300494 | MONDO:equivalentObsolete |
 | MONDO:0010343 | OMIM:300497 | MONDO:equivalentObsolete |
 | MONDO:0010346 | OMIM:300504 | MONDO:equivalentObsolete |
 | MONDO:0010357 | OMIM:300551 | MONDO:equivalentObsolete |
-| MONDO:0010368 | OMIM:300584 | MONDO:equivalentObsolete |
 | MONDO:0010387 | OMIM:300640 | MONDO:equivalentObsolete |
 | MONDO:0010394 | OMIM:300660 | MONDO:equivalentObsolete |
 | MONDO:0010470 | OMIM:300881 | MONDO:equivalentObsolete |
 | MONDO:0010527 | OMIM:301590 | MONDO:equivalentObsolete |
-| MONDO:0010600 | OMIM:138990 | MONDO:equivalentObsolete |
 | MONDO:0010601 | OMIM:306500 | MONDO:equivalentObsolete |
 | MONDO:0010666 | OMIM:309605 | MONDO:equivalentObsolete |
-| MONDO:0010720 | OMIM:307300 | MONDO:equivalentObsolete |
-| MONDO:0010720 | OMIM:312100 | MONDO:equivalentObsolete |
 | MONDO:0010804 | OMIM:600048 | MONDO:equivalentObsolete |
 | MONDO:0010859 | OMIM:600309 | MONDO:equivalentObsolete |
-| MONDO:0010911 | OMIM:600634 | MONDO:equivalentObsolete |
-| MONDO:0010936 | OMIM:614696 | MONDO:equivalentObsolete |
-| MONDO:0010957 | OMIM:600908 | MONDO:equivalentObsolete |
 | MONDO:0010975 | OMIM:600996 | MONDO:equivalentObsolete |
 | MONDO:0011111 | OMIM:601563 | MONDO:equivalentObsolete |
-| MONDO:0011362 | OMIM:607569 | MONDO:equivalentObsolete |
-| MONDO:0011401 | OMIM:611155 | MONDO:equivalentObsolete |
 | MONDO:0011543 | OMIM:605365 | MONDO:equivalentObsolete |
-| MONDO:0011806 | OMIM:609143 | MONDO:equivalentObsolete |
-| MONDO:0011835 | OMIM:613832 | MONDO:equivalentObsolete |
 | MONDO:0011910 | OMIM:607801 | MONDO:equivalentObsolete |
-| MONDO:0011939 | OMIM:271550 | MONDO:equivalentObsolete |
-| MONDO:0012017 | OMIM:608355 | MONDO:equivalentObsolete |
-| MONDO:0012215 | OMIM:159000 | MONDO:equivalentObsolete |
-| MONDO:0012247 | OMIM:609307 | MONDO:equivalentObsolete |
 | MONDO:0012279 | OMIM:609456 | MONDO:equivalentObsolete |
 | MONDO:0012461 | OMIM:610269 | MONDO:equivalentObsolete |
 | MONDO:0012560 | OMIM:610799 | MONDO:equivalentObsolete |
-| MONDO:0012853 | OMIM:233500 | MONDO:equivalentObsolete |
-| MONDO:0012878 | OMIM:612359 | MONDO:equivalentObsolete |
-| MONDO:0013476 | OMIM:613875 | MONDO:equivalentObsolete |
 | MONDO:0013596 | OMIM:614157 | MONDO:equivalentObsolete |
 | MONDO:0013617 | OMIM:614192 | MONDO:equivalentObsolete |
 | MONDO:0013701 | OMIM:614339 | MONDO:equivalentObsolete |
-| MONDO:0013736 | OMIM:614408 | MONDO:equivalentObsolete |
-| MONDO:0013753 | OMIM:608591 | MONDO:equivalentObsolete |
-| MONDO:0014045 | OMIM:615106 | MONDO:equivalentObsolete |
-| MONDO:0014089 | OMIM:616964 | MONDO:equivalentObsolete |
-| MONDO:0014243 | OMIM:208080 | MONDO:equivalentObsolete |
-| MONDO:0014353 | OMIM:216920 | MONDO:equivalentObsolete |
-| MONDO:0014806 | OMIM:271225 | MONDO:equivalentObsolete |
 | MONDO:0014849 | OMIM:616958 | MONDO:equivalentObsolete |
-| MONDO:0015912 | OMIM:153640 | MONDO:equivalentObsolete |
-| MONDO:0015912 | OMIM:600208 | MONDO:equivalentObsolete |
-| MONDO:0015912 | OMIM:605249 | MONDO:equivalentObsolete |
 | MONDO:0017996 | OMIM:615057 | MONDO:equivalentObsolete |
 | MONDO:0018138 | OMIM:103470 | MONDO:equivalentObsolete |
 | MONDO:0019348 | OMIM:300537 | MONDO:equivalentObsolete |
 | MONDO:0020668 | OMIM:600146 | MONDO:equivalentObsolete |
-| MONDO:0021569 | OMIM:159001 | MONDO:equivalentObsolete |
 | MONDO:0023873 | OMIM:163955 | MONDO:equivalentObsolete |
 | MONDO:0024293 | OMIM:175020 | MONDO:equivalentObsolete |
 | MONDO:0024996 | OMIM:276905 | MONDO:equivalentObsolete |
-| MONDO:0027416 | OMIM:601251 | MONDO:equivalentObsolete |
-| MONDO:0030914 | OMIM:300602 | MONDO:equivalentObsolete |
-| MONDO:0033613 | OMIM:603513 | MONDO:equivalentObsolete |
-| MONDO:0100255 | OMIM:611094 | MONDO:equivalentObsolete |
+| MONDO:0027416 | OMIM:601251 | MONDO:equivalentObsolete |